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單細(xì)胞基因組學(xué)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)取得新進(jìn)展,支原體祛除噴霧助力科研

更新時(shí)間:2024-06-02  |  點(diǎn)擊率:510

單細(xì)胞基因組學(xué)是一個(gè)精密的科研學(xué)科,每一個(gè)單獨(dú)的細(xì)胞都彌足珍貴,包含著多樣的遺傳信息,是打開生命科學(xué)一把鑰匙。在進(jìn)行單細(xì)胞基因組學(xué)的實(shí)驗(yàn)室中,確保實(shí)驗(yàn)環(huán)境的純凈、避免細(xì)胞污染十分重要。德國MB公司生產(chǎn)的Mycoplasma Off,高效清除實(shí)驗(yàn)環(huán)境中的支原體、細(xì)菌等微生物污染

 

單細(xì)胞基因組學(xué)提供了一種強(qiáng)大的方法來了解變異如何影響基因表達(dá),特別是在人類大腦中眾多細(xì)胞類型中。此外,它可能會改善我們對大腦相關(guān)特征的調(diào)節(jié)機(jī)制的理解。然而,需要具有廣泛腦表型的群體規(guī)模隊(duì)列來推斷變體之間的關(guān)鍵關(guān)聯(lián),并在單細(xì)胞規(guī)模上開發(fā)調(diào)節(jié)模型。

 

近日,科研人員為了解決這個(gè)問題,對受實(shí)驗(yàn)者進(jìn)行了許多單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)[單核RNA測序(snRNA-seq)、snATAC-seq (ATAC,轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)測定)snMultiome +基因分型]和前額葉皮層樣本的計(jì)算分析。

 

相關(guān)研究成果發(fā)表在《Science》上,文章標(biāo)題為:“Single-cell genomics and regulatory networks for 388 human brains"??蒲腥藛T使用單核RNA測序 (snRNA-seq)、單核ATAC-seq測序及單核Multiome測序,并結(jié)合基因分型和計(jì)算分析,對含超過280萬個(gè)單細(xì)胞核在內(nèi)的388份人腦前額葉皮層樣本進(jìn)行了深度測序,并結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型、eQTL (表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)),構(gòu)建了細(xì)胞類型特異性的基因調(diào)控和細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò),揭示了不同細(xì)胞類型在老齡化和神經(jīng)精神疾病中的特定改變。

 

該項(xiàng)研究的人類大腦的人口規(guī)模單細(xì)胞資源,可以幫助促進(jìn)神經(jīng)精神疾病的精確醫(yī)學(xué)方法,特別是通過優(yōu)先考慮與細(xì)胞類型相關(guān)的后續(xù)基因和藥物靶點(diǎn)。


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